1940’erne startede med den bedste placering for Fremad Amager nogensinde, en andenplads kun to points efter danmarksmesteren KB. Det så lovende ud, men Nazitysklands besættelse af Danmark kom i vejen, og danmarksturneringen blev omlagt til lokale kredse, og senere spilledes kampene endog uden tilskuere.

Efter besættelsen kom danmarksturneringen i gang igen, fortsat med Fremad i 1. division og med to gode placeringer i 1946 (nr. 3) og 1947 (nr. 5). Men i 1948 gik turen til 2. division, og der skulle gå 27 år før Fremad Amager genså 1. division.

Fremads første "rigtige"  landsholdsspiller, Oscar Theisen, stoppede, og to andre profiler, Kai Frandsen og Leif Pedersen blev professionelle i Italien, så de følgende år var vi kun "lige ved og næsten".

Selv om vi i samme periode gik over til at spille hjemmekampene i kirketiden, forblev 1. division det forjættede land. Og så havde vi endda ikke oplevet den værste nedtur endnu …